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Cluster de calcul

Exécuter des calculs parallèles dans un environnement hautement productif pour le Muséum National d'Histoire Naturelle de Paris

Profil du client : Muséum National d'Histoire Naturelle de Paris
Objectifs :

    • Exécuter des calculs parallèles pour une application phylogénétique dans un envirronement Linux
    • Mettre en place une solution évolutive permettant l'ajout de noeuds supplémentaires sans surcoût
    • Déployer une méthode d'administration simple et efficace du cluster


Solutions : Cette prestation a été réalisée en trois grandes étapes :

    • Création du noeud de calcul type
      • Optimisation des ressources
      • Sécurisation des accès
      • Tuning réseau/système
    • Création du coeur de cluster : ce coeur assure les fonctions essentielles au bon fonctionnement de l'ensemble :
      • Système d'installation automatique des noeuds (DHCP/PXE/NFS)
      • Administration et mises à jour centralisée sur un repository local
      • Authentification des utilisateurs du cluster et serveur de fichiers
      • Monitoring des noeuds et des ressources du cluster
      • Mise en haute disponibilité du coeur par Red Hat Cluster Manager
    • Application de calcul phylogénétique
      • Packaging de l'application en RPM pour l'intégration au repository et l'installation automatique par le coeur.
      • Compilation et optimisation pour la plateforme matérielle (AMD64)

  • La solution compte actuellement 11 noeuds de calcul et le coeur est constitué de 2 serveurs reliés à une baie de disques. Les noeuds utilisent Fedora Core et le coeur repose sur Red Hat Enterprise Linux.